Козятинським МЦ ПМСД проводиться вакцинація дитячого та дорослого населення проти таких інфекційних захворювань: туберкульоз, дифтерія, правець, кашлюк, поліомієліт, гемофільна інфекція, гепатит B, кір, краснуха, епідемічний паротит, грип, а з 2021 року також проводиться імунопрофілактика проти коронавірусної інфекції. За епідемічними та медичними показами проводиться імунопрофілактика проти пневмококової інфекцій, ротавірусів, папіловірусів та сказу.